水垢的熱阻也高于換熱器的管壁，會影響傳熱效率，升高冷凝壓力。當冷凝器內水管壁結水垢1.5mm時，冷凝溫度就要比原來的溫度上升2.8℃，耗電量增加百分之九點七。另外水垢還會增加降溫水的流動阻力，增加水泵的能耗。
預防和清理水垢的方法可以使用電子磁水器除垢防垢、化學酸洗除垢、機械除垢等。優先選用熱氣融霜代替電加熱融霜，減少耗電?？梢岳脡嚎s機排熱作為融霜熱源。沖霜回水的溫度一般比冷凝器進水溫度低7~10℃，經過處理后可以作為冷凝器的降溫水，降低冷凝溫度。
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