果蔬在入庫前一定要挑選細節，要把帶機械傷、蟲傷或成熟度不同的果蔬分別剔除。因為果蔬中含有大量的水分和營養物質，是微生物生活的良好培養基。被微生物污染的果蔬很快就會全部腐爛變質。

不同成熟度的果蔬也不宜混在一起保藏。因為較成熟的果蔬，再經過一段時間保藏后會形成過熟現象，其特點是果體變軟，并即將開始腐爛。有些果蔬經過挑選后，質量好的、可以長期冷藏的應逐個用紙包裹，并裝箱或裝筐。

有柄的水果在裝箱（筐）時，要特別注意勿將果柄壓在周圍的果體上，以免把別的水果果皮碰破。在整個挑選整理過程中，都要特別注意輕拿輕放，以防止因工作不慎而使果體受傷。

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